Lokalitu tvoří zalesněný kopec Skalky mezi obcemi Třebutičky, Encovany a Sedlec. Vrch Skalky je krajinnou dominantou okolí.
Lesní porost představuje mimořádně zachovalou ukázku vegetace teplomilných doubrav, jejichž druhová skladba odpovídá svým složením původním přirozeným lesům v oblasti. Ve stromovém patře dominuje dub zimní (Quercus petraea), s malou příměsí dalších typických druhů - habru obecného (Carpinus betulus) a lípy srdčité (Tilia cordata). Na jižních a jihozápadních svazích porost přechází v teplomilné doubravy s hojným zastoupením dubu pýřitého (Q. pubescens) a javoru babyka (Acer campestre). V keřovám patře je hojný dřín obecný (Cornus mas), z bylin kamejka modronachová (Lithospermum purpurocaeruleum).
Území je v Čechách jedinou lokalitou s výskytem kriticky ohrožené bažanky vejčité (Mercurialis ovata). Bažanka vejčitá je jihovýchodoevropský druh, jehož areál rozšíření se táhne od pobřeží Černého moře a Turecka až do střední Evropy. Lokalita Skalky je nejvíce vysunutým výskytem tohoto druhu k severozápadu. Bažanka zde roste v lesích při jižním úpatí vrchu Skalky.
Okrajově a maloplošně se v území vyskytují polopřirozené suché trávníky.
Další informace je také možné získat ZDE na stránkách občanského sdružení Salvia, které pro toto území zpracovalo návrh plánu péče.